بالنسبة لتداول الشركات المقيدة تحصل البورصة على عمولة قدرها 0.012 % ( 12 لكل 100 ألف جنيه ) من قيمة كل عملية تداول وذلك من كل طرف على حدة بحد أقصى 5000 جنيه مصري.
بالنسبة لتداول الشركات غير المقيدة تحصل البورصة على عمولة قدرها 0.1% من قيمة كل عملية تداول وذلك من كل طرف على حدة بحد أقصى 50,000 جنيه مصري.
بالنسبة لعمليات استبدال شهادات الإيداع الدولية تحصل البورصة على عمولة قدرها 0.00025% من قيمة كل عملية استبدال، ويتم تحصيل هذه القيمة بالدولار الأمريكي.